การทางพิเศษแห่งประเทศไทย (กทพ.) กระทรวงคมนาคม ได้นำทางพิเศษเฉลิมมหานครเข้าสู่ระบบบริหารงานคุณภาพ ด้านบริการ ISO 9000 เมื่อวันที่ 7 เมษายน 2542 และต่อมาในวันที่ 8 พฤษภาคม 2543 กทพ. ได้รับใบรับรองระบบบริหารงานคุณภาพ ISO 9000 : 1994 ฉบับแรก จากนั้น กทพ. ได้ดำเนินการรักษาระบบฯ ปรับปรุงและพัฒนาระบบการให้บริการตามมาตรฐาน ISO 9001 ซึ่งมีการปรับเปลี่ยนเวอร์ชันมาอย่างต่อเนื่อง
ปัจจุบัน กทพ. ได้ประยุกต์ใช้มาตรฐานระบบบริหารคุณภาพด้านบริการ หรือ ISO 9001 : 2015 ไปใช้ ในทุกด่านเก็บค่าผ่านทางพิเศษที่อยู่ในความรับผิดชอบ โดยมี ทางพิเศษเฉลิมมหานคร และทางพิเศษกาญจนาภิเษก เป็นทางพิเศษที่ผ่านการตรวจประเมินระบบคุณภาพด้านบริการ ISO 9001 : 2015 ขอบเขตการให้บริการรับชำระค่าผ่านทาง และการควบคุมการจราจรบริเวณด่านเก็บค่าผ่านทางพิเศษ ซึ่ง กทพ. ยังคงรักษามาตรฐาน และได้รับการรับรองมาอย่างต่อเนื่อง และได้กำหนดแนวทางการบริการเพิ่มเติมหลายด้าน เพื่อรักษาคุณภาพการให้บริการ โดยเฉพาะการนำนวัตกรรมและเทคโนโลยีมาใช้พัฒนาการให้บริการด้านงานชำระค่าผ่านทางพิเศษ และการควบคุมการจราจรเพื่อความสะดวก รวดเร็ว ปลอดภัย และสร้างความพึงพอใจให้กับผู้ใช้บริการทางพิเศษได้อย่างยั่งยืน
นอกจากมาตรฐานปัจจุบัน กทพ. ยังเตรียมความพร้อมเข้าสู่การปรับปรุงมาตรฐานสากลเวอร์ชันใหม่ (ISO 9001 : 2026) ที่คาดว่าจะประกาศใช้ในอนาคตอันใกล้ ซึ่งจะเน้นประเด็นความยั่งยืน (Sustainability) การใช้เทคโนโลยี AI และนวัตกรรมดิจิทัลมาช่วยเพิ่มประสิทธิภาพการทำงาน สอดคล้องกับวิสัยทัศน์ขององค์กร ที่มุ่งสู่การเป็น “องค์กรนวัตกรรมเพื่อการเดินทาง และคุณภาพชีวิตที่ดีขึ้น” ซึ่งนอกจากด้านบริการ กทพ. ยังคงรักษาระบบการจัดการสิ่งแวดล้อม ISO 14001:2015 อย่างเคร่งครัด เพื่อลดผลกระทบต่อชุมชนและสิ่งแวดล้อมรอบแนวสายทาง
